博文
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荧光原位杂交(FISH)样本处理标准方案系列(一)——常规石蜡包埋组织切片
常规石蜡包埋组织切片(常规切片)是组织学常规制片技术中最为广泛应用的方法,在病理学中常用以研究、观察及判断细胞组织的形态变化,与免疫学技术结合可用于组织切片中细胞组织的多肽及蛋白质等大分子物质的定性和
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操作中,只要注意上述提到的关键点,相信大家也一定可以做出漂亮的样本片!附录:主要试剂配制表: 查看全文>>
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急性淋巴细胞白血病(ALL)染色体及基因异常检测试剂盒(FISH)-诊断分型、预后判断、病情监测
急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblasticleukemia, ALL)是由于原始及幼稚淋巴细胞在造血组织异常增殖并可浸润各组织脏器的一种造血系统恶性克隆性疾病。WHO(2008)分类认
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(MICM),对于了解ALL生物学本质、实现ALL准确的诊断分型、设计治疗和判断预后极为有益。 查看全文>>
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软组织肉瘤辅助诊断方法——FISH探针系列
软组织肉瘤( soft tissuesarcoma,STS )是一类起源不同,形态学复杂多样的恶性肿瘤。显微镜下的形态学评估一直是肉瘤诊断的金标准。而软组织肿块的鉴别诊断包括其他恶性病变(如原发或转移
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:前已发现的肉瘤基因变异,见下表1:(引用2011年NCCN软组织肉瘤诊疗指南) 查看全文>>
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乳腺癌HER2/TOP2A共扩增:穷人的福音
自上世纪80年代以来,大量临床试验证明,蒽环类药物是乳腺癌化疗方案的基石,可降低乳腺癌患者的复发率和提高生存期。截至2000年,美国有超过80%的小于70岁的淋巴结阳性乳腺癌患者和超过70%的小于70
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apy. Journal of ClinicalOncology, 29(7). 查看全文>>
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手把手教你建立FISH阈值
阅读一份FISH新产品的说明书时,最让我们关注的便是不同信号的解释和判读阈值的给出。阈值是什么?阈值又叫参考值,是体外诊断试剂的重要指标之一,也是临床使用判断被检测样本是否异常的重要依据。在临床检测中
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M)+3 x 标准差(SD)】小编说:跟着我的ABC,建立阈值好轻松。你们学会了吗? 查看全文>>
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EGFR FISH的预测能力与突变相当——中山大学肿瘤医院数据引起的思考
首先声明,本文摘录了最近三年的一些针对非小细胞肺癌(NSCLC)中EGFR状态(基因扩增和基因突变)究竟哪个更合适作为临床标志物检测的综述观点,特别是2013年中山大学肿瘤医院邵建永等人发表的数据,以
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cancer. J Clin Pathol, 2009, 62:970-977. 查看全文>>
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HEAT MAP 相关
这类图多用在需要表现数据的变化情况(例如基因的上调下调、基因互作程度等)的地方。现在能做heatmap的软件已经有很多,除了常用的R,mathlab之外还有如SPSS,heatmap bulider等
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改为合适样式使用选择工具将其拖动到合适位置Step3.3更改整体比例,让图片协调 查看全文>>
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NGS 常用名词
什么是高通量测序?高通量测序技术(High-throughput sequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定,
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别和基因功能注释两个方面。基因识别的核心是确定全基因组序列中所有基因的确切位置。 查看全文>>
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NGS数据处理流程
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全基因组重测序概要
无论是基于某一群体或者家系的全基因组重测序数据,信息分析内容大致包括以下几个方面:初级分析内容:主要包括calling SNP、calling InDel/CNV/SNV、以及calling stru
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t[J]. Nature, 2010, 464(7291): 999-1005. 查看全文>>