间叶性标记分为广谱性和特异性两类，广谱性标记如波形蛋白已如前述，特异性标记是指专用于各种间叶组织的标记。

1.肌源性标记：也分为广谱性（适用于所有肌肉组织）和特异性两种，后者用于平滑肌、横纹肌和心肌，以及成肌纤维细胞、肌上皮细胞等含有肌纤维成分的细胞，上文已有简述。

2.淋巴细胞标记：淋巴细胞种类繁多，相关标记也很多，上文已有简述。

3.脉管组织：血管和淋巴管含有内皮细胞和平滑肌两种成分，平滑肌成分可用SMA、Calponin等标记，血管内皮细胞表达第Ⅷ因子、CD31、CD34、荆豆凝集素（UEA-1）等，波形蛋白也可阳性，淋巴管内皮细胞表达D2-40，具有特异性。

4.骨和软骨组织：成熟骨与软骨组织无需标记，相关肿瘤常用的标记有骨形态发生蛋白（bone morphogenetic protein,BMP）、骨钙素（osteocalcin）骨粘连蛋白（osteonectin）等，S-100蛋白也可表达于软骨组织或软骨样分化的肿瘤中。骨肉瘤总是表达波形蛋白，同时表达BMP、骨钙素和骨粘连蛋白。

5.脂肪组织：本来分化成熟的脂肪形态特殊，无需标记。但低分化或去分化的肿瘤中，脂肪母细胞不易发现和识别，需要借助免疫组化标记。常用的标记有波形蛋白和S-100蛋白，但两者并非特异性。S-100蛋白原是神经性标记，用于神经胶质细胞、神经膜细胞及其发生的肿瘤，后来发现S-100蛋白尚可表达于脂肪、软骨等组织。

6.纤维组织：纤维组织普遍表达波形蛋白，缺乏特异性标记，但在某些纤维性肿瘤可以表达肌源性标记，这可能与肿瘤中含有成肌纤维母细胞有关；还有所谓纤维组织细胞肿瘤，含有成纤维细胞、成肌纤维细胞、组织细胞，还可以表达组织细胞标记，如CD68、α-AT、α-ACT等。

所谓软组织肿瘤，大多是间叶性肿瘤，常用于软组织肿瘤的标记有广谱的波形蛋白（vimentin），肌源性标记（结蛋白、肌动蛋白、肌红蛋白、肌球蛋白、肌浆蛋白、肌源性调节蛋白等），内皮细胞标记（第八因子相关抗原、CD31、CD34等），组织细胞标记（CD68、AAT、AACT、溶菌酶等）等。但这些标记只有相对特异性，可见于一组肿瘤，如CD34可见于孤立性纤维性肿瘤、胃肠道间质瘤、隆突性皮肤纤维肉瘤、卡波西肉瘤等多种软组织肿瘤，因此需结合形态学表现综合判断。

还有一些间叶性软组织肿瘤，分化较低，初步诊断常以细胞形态和组织特征命名，如小圆形细胞肿瘤、梭形细胞肿瘤、上皮样细胞肿瘤、多形性细胞肿瘤等。在免疫组化的辅助下，可以进一步确定上述各种形态的细胞本质、来源或分化方向。以梭形细胞为例，可以分别是纤维性、平滑肌性、血管周细胞性、神经鞘膜性、滑膜性、血管内皮性等。由此可见熟悉间叶性标记具有重要的诊断意义。

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