恶性外周神经鞘瘤最常见于颈部、前壁、下肢和臀部等处软组织，发生于直肠的恶性神经鞘瘤少见。肉眼观察：发生于直肠的恶性神经鞘瘤与发生于身体其他部位的恶性神经鞘瘤在形态上相似，肿瘤常呈灰白色，质细腻，切面呈灰白色，可见坏死。显微镜下：肿瘤主要由异型梭形瘤细胞所构成。瘤细胞可排列成束状、漩涡状，偶见栅栏状排列，核分裂像多见，肿瘤内常有出血坏死。肿瘤内有时可发现化生性组织，如化生的软骨组织、骨组织及肌肉等。免疫组化染色见瘤细胞表达S-100蛋白阳性，CD34及CD117阴性。诊断直肠恶性神经鞘瘤时应注意与恶性间质瘤相鉴别。恶性间质瘤的组织学表现呈多样性，肿瘤主要由不同数量和比例的梭形细胞和上皮样细胞所构成。梭形瘤细胞与平滑肌细胞或神经源性细胞十分相似，在光镜下难以区分。其与恶性神经鞘瘤的鉴别诊断主要依靠免疫组化。恶性间质瘤免疫组化染色见瘤细胞表达CD34及CD117阳性，瘤细胞表达S-100蛋白及NSE阴性。恶性神经鞘瘤瘤细胞表达S-100蛋白及NSE阳性，CD34及CD117阴性。此外恶性神经鞘瘤尚需与黑色素瘤、平滑肌肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、分化差的梭形细胞癌等相鉴别。其鉴别主要依靠免疫组化，其鉴别诊断一般不困难。