诊断肝细胞癌时应注意与肝腺瘤、肝脏局灶性结节性增生、腺瘤样增生结节、肝转移癌及肝血管平滑肌脂肪瘤等相鉴别。1、与肝腺瘤的鉴别：当肝腺瘤内瘤细胞出现较广泛的异型性时，其与高分化肝细胞癌的鉴别常较困难。两者的不同点主要为：①腺瘤极少发生于肝硬化的肝脏。②腺瘤可有明显的纤维包膜，其挤压周围肝组织。③腺瘤内瘤细胞异型性较轻，多形性不明显。④网织纤维染色见腺瘤内仍保持正常的网状纤维分布状况。⑤免疫组化染色见腺瘤内血窦内皮细胞大多数表达CD34阴性。肝细胞癌的特点则为：①肿瘤周围肝组织常有肝硬化。②肿瘤无包膜，常呈浸润性生长。③瘤细胞胞浆呈嗜碱性，细胞核异型性明显，核分裂像多见。④肝细胞板较厚（多于3个肝细胞），细胞可呈假腺样排列。⑤免疫组化染色见瘤细胞表达AFP阳性，血窦内皮细胞大多数表达CD34阳性。2、与肝脏灶性结节性增生的鉴别：肝脏灶性结节性增生的肝细胞可排列紊乱，并可出现细胞核深染的再生肝细胞，易误诊为高分化肝细胞癌。但肝细胞癌常伴有肝硬化，患者血清AFP阳性，肿块中央无星状瘢痕；显微镜下见瘤细胞异型性明显，细胞浆呈嗜碱性，核分裂像易见，癌细胞排列成多层，常在3层以上；免疫组化染色见血窦内皮细胞大多数表达CD34阳性可与肝脏局灶性结节性增生相鉴别。3、与腺瘤样增生结节的鉴别：腺瘤样增生结节内肝细胞异型性不明显或较轻，可见肝动脉、肝门静脉和胆管组成的汇管区结构。而肝细胞癌则瘤细胞异型性及多形性较明显，核分裂像较多见，瘤细胞排列成较厚的多层肝细胞板，瘤组织内不可见汇管区结构。4、与肝转移癌的鉴别：肝转移癌很少与肝硬化并存，肿瘤内纤维组织增生反应常较显著，肿瘤组织内血窦不丰富，免疫组化染色见瘤细胞常表达AFP阴性，但有时胃腺癌及生殖细胞来源的肿瘤也可呈AFP阳性，最重要是患者体内其他部位有肿瘤原发灶存在。肝细胞癌则间质内血窦异常丰富，除了硬化型肝细胞癌以外间质内纤维组织成分极少，免疫组化染色见瘤细胞表达AFP强阳性，患者血清内可有高滴度的AFP，患者体内其他部位无原发性肿瘤。5、与肝血管平滑肌脂肪瘤的鉴别：肿瘤内或多或少可见到一些脂肪细胞和血管成分，瘤细胞不形成腺样结构，平滑肌细胞异型性不明显，无核分裂像，肿瘤周围的肝组织无肝硬化，免疫组化染色见瘤细胞表达HMB45及SMA阳性，表达Hep Parl阴性，上述表现均与肝细胞癌不同，具有重要的鉴别诊断意义。