子宫内膜透明细胞腺癌是一种子宫内膜腺癌，组织学上以乳头状和管囊状结构以及出现透明细胞、嗜酸细胞和“鞋钉”细胞为特征。显微镜下：透明细胞腺癌发生在阴道、宫颈和卵巢以及子宫内膜。所有四个部位发生的透明细胞腺癌的组织学表现相同，可见4种形态结构，按其出现的频率依次为乳头状、腺管状、实性和管囊状。大多数透明细胞腺癌至少有两种组织形态混合存在。在管囊状区域，内衬囊肿的上皮细胞常常含有非常少的胞质，以致增大的多形性细胞核似乎向腔内突出，呈现“鞋钉”样外观。然而，透明细胞腺癌最突出的诊断特征是许多细胞胞质透明。胞质中存在的糖原在正常固定的制片过程中被溶解。如果出现粘液，仅仅见于由透明细胞组成的腺腔内。胞质内没有粘液。间质可能致密和玻璃样变，特别是在管囊状的区域。细胞核的多形性通常明显，核分裂象多少不等。