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细胞遗传学实验室
这周主要在细胞遗传学实验室学习了一下。这个实验室名义上是属于UPMC妇产科的,也在Magee-Womens Hospital。然而大量的标本来自于UPMC下属的各家医院。最主要的标本来自Presbyterian Hospital和儿童医院的血液科、血液病病理科的外周血、骨髓涂片、骨髓活检等,其次是产前的一些检查:包括羊水、流产或活检的绒毛和死胎、死产胎儿等。然后就是一些肿瘤,最多见的就是乳腺癌、淋巴瘤、软组织肿瘤等。
因为只有一周时间,而且最主要关注的是我们准备开展的FISH检测,所以大部分时间用在参观FISH的制备过程和结果判读上。跟着我的校友Dr. Jie Hu(实验室副主任)阅读了几例基因组杂交检测和染色体的报告。参加了Journal Club和血液科和儿科的Tumor board。
实验室的主要手段是细胞培养、染色体制备和各类Band染色(主要是G带),FISH和aCGH(分子病理包括PCR和测序是另外实验室的工作,而且分子遗传和细胞遗传是不同的执业执照)。
FISH方面,也没有对比过别的实验室,仅就这里的实验方法谈谈感想。制片是一个技术员完全手工制备的。切片、涂片或悬浮细胞一般早上会有一批,但中途随时随地送来,而且有多种类型的标本,处理有很大差别,我很佩服她能记得每一张切片处于哪一个步骤、在哪一个瓶子里。计时器是必不可少的,而且有4-5个,闹起来此起彼伏。她很热情地和我解释,真有些不好意思,所以就5点走了,她还在做,第二天很客气地告诉我说只让她多花了15分钟。
切片先根据病理医生勾出的位置在反面用铁笔刻出痕迹。在每一个步骤间都会习惯性地看一下圈里的组织有没有脱落。悬浮细胞会固定、离心,距离很高地滴在切片上,每滴之间会保持一定距离,再用显微镜看一下,找细胞不能多不能少的位置,同样做上记号。所有的试剂都用一天并在前一天配好,用标签写好使用日期,每一个水浴箱、烤箱的温度都会有温度计去测到准确为止。使用的探针每一次的用量都会记录在日志上,探针只有相同的批号的能够混合,不然会做相应的阳性对照。如果步骤中间有些异常也会及时记录,以便寻找原因。例如在变性前,切片出现了一下雾状的杂质,她说会经常出现,如果在变性后还存在的话她就会记录下来。
完成一整套FISH的技术员的培训时间需要2年,主要由所在科室培训。包括制片、读片。读荧光信号都是人工完成的,不是用电脑数的,拍的照片是用在报告中的。两个技术员独立的数不同组织位置的相应细胞量,如HER2/neu要求是每人各数20个。还会用到数血细胞的手按的计数器。读片的培训是先读单荧光信号、再发展到双荧光、再是一些融合基因信号、最后才可以读HER2的信号。
由于遗传学诊断在临床的密切参与,所以可以发现很多的染色体异常相关的综合征。另外,病理诊断(主要是造血、淋巴系统)会很准确。对于病人的治疗也会有相应的帮助。这些多学科的肿瘤讨论会上,会有细胞遗传学医生和遗传咨询医生的参与,对于肿瘤病人的个体化治疗和个体化的预后评估很有帮助。
另外,http://pittgenetics.com/,这是他们实验室的网站。里面有很多实用的内容,包括各种临床疾病相关的检查项目和结果的解读。可供参考。
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