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4篇Nature披露不为人知的基因突变

2016-05-13 19:51  阅读(252)  评论(0)  分类:科研学术

来源:生物探索

近年来,随着基因组技术的发展,与乳腺癌相关的基因分子逐步被揭晓,关于乳腺癌基因突变的研究也相继报道在各大国际顶级期刊上。5月2日,《Nature》及《Nature communication》揭示了93个与乳腺癌相关的基因以及12种不同的体细胞突变,5月10日《Nature communication》又披露了与乳腺癌发展相关的40个基因突变,也是2012年《Nature》上关于乳腺癌分子分型研究的延伸。

  《Nature》:乳腺癌可分为10种不同的类型(文献)

  2012年,《Nature》报道了首个最大的乳腺癌分子分型研究——METABRIC研究。研究人员综合了基因组和转录组来说明乳腺癌的分子分型及驱动分子,揭示了997个原发性乳腺肿瘤的完整拷贝数和995个原发性乳腺肿瘤的基因表达。结果发现,在超过40%的基因中,遗传变异和获得性体细胞拷贝数变异(CNAs)与基因表达有关。通过确定存在突变的异常基因,研究人员确定了一些公认的致癌基因突变,包括PPP2R2A、MTAP 和MAP2K4基因中的碱基缺失。分子分型分析揭示了不同亚群具有不同的临床结果,研究人员最后认为乳腺癌可分为10种不同的疾病。

  《Nature Communications》:披露40个与乳腺癌发展相关的基因突变(文献)

  5月10日,《Nature Communications》上的研究对2012年的METABRIC研究深入解析,披露了与乳腺癌发展及遗传变异相关的新型遗传信息。在该研究中,剑桥大学的研究人员分析了METABRIC研究的肿瘤样本,试图进一步分析10种不同乳腺癌的遗传缺陷。

  在此次研究中,研究人员发现了40个与乳腺癌发展相关的基因突变,在此之前,这40个基因中只有少部分被认为与乳腺癌发展相关。此外,研究人员还发现,最常见的基因突变——PIK3CA与3种亚型乳腺癌的低存活率相关,这有助于解释为何靶向PIK3CA的药物仅对部分患者有效。研究人员认为该研究结果可为将来研发针对这类缺陷的靶向药物提供帮助,同时有助于改进乳腺癌相关的研究设计。

  该研究的第一作者,Carlos Caldas教授说,“METABRIC研究制定了乳腺癌的遗传图谱,而本研究让我们更详细地了解与不同类型乳腺癌发展相关的遗传缺陷。这些结果有助于将来乳腺癌临床试验的设计。”同时研究人员表示将对外公布这些详细的结果,以帮助更多人。

  英国癌症研究中心的首席临床医师Peter Johnson教授说,“该研究再次强调了癌症的复杂性,但如今我们比以往能更快地解决这些难题。这项研究告诉我们为何某种类型的乳腺癌更加难治愈,该研究将有助于发明新的诊断测试,以更好地指导乳腺癌的治疗。”

  《Nature》及《Nature Communications》:93个与乳腺癌相关的基因(文献1)及12种不同的体细胞突变(文献2)

  5月2日,《Nature》分析了560个乳腺癌全基因组序列,鉴定出了与乳腺癌相关的93个基因以及其他一些非编码区的突变。同时在《Nature Communications》绘制了乳腺癌基因组突变的过程。下图为研究人员找到的93条基因,黄色高亮的为与乳腺癌相关的新基因,或有新的证据将它与乳腺癌进行联系。

黄色高亮的为与乳腺癌相关的新基因

  图片来源:药明康德

  此外,研究人员寻找了促使癌症生长的突变,并搜寻每个患者的突变特征,结果发现,携带BRCA1或BRCA2基因的女性,患乳腺癌及卵巢癌的风险增加,这类患者之间的癌症基因图谱差别很大,并与其他类型的乳腺癌有很大的差异,这一发现有助于对患者的精准分类治疗。

  十二类不同的体细胞突变样式(图片来源:药明康德)

十二类不同的体细胞突变样式

  研究人员还发现了12类不同的体细胞突变样式,它们有的与家族遗传有关,有的由病毒感染等外界因素导致,有些则原因尚不明确。尽管如此,这项研究依然给我们带来了大量的新信息,并且指明了未来研究的方向。


 

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