在过去的几十年间，随着芯片技术和测序技术的进步，为详细理解肿瘤基因组提供了一份详细的蓝图。很多研究试图将这些先进的知识和临床评估参数相结合，如生存期相关参数。

我们希望，在临床实践中，能通过分子生物学标记对患者进行分层，从而针对不同的亚组患者选择特异的治疗方案。成功的靶向制剂包括伊马替尼和靶向针对 Her2、EGFR 和 B-raf 的抑制剂。这些药物为具有存在特定基因变化的患者带来了临床获益。

然而，目前通过利用新出现的预后预测生物标记来制定针对患者个体的治疗策略，在这方面的研究工作还比较缺乏。

既往的研究已经确定并验证了在 1040 例食管 - 胃肿瘤患者中，TRIM44（一个新确定的具有预后预测价值的基因）具有预后预测的价值。最近发表的一篇研究也提示在 TRIM44 过度表达的胃癌中肿瘤的侵袭性更强。然而，TRIM44 在肿瘤中的功能性作者用和潜在治疗作用并未得到很好的阐述。

在本研究中，来自于英国 MRC 研究中心的 Fitzgerald 等为了评估在过度表达 TRIM44 的患者中，该基因对治疗方案制定的指导意义而设计了相关研究，并将研究结果发表在 JNCI 4 月的在线期刊上。

研究者所纳入的基因组和转录组的数据来自于 1932 例上皮肿瘤患者、1980 例乳腺癌患者和 163 例食管癌患者，用以确定导致 TRIM44 过度表达的染色体畸变。研究者采用小干扰 RNA（siRNA）对 11p13 扩增子进行筛查以确定 TRIM44 驱动基因的状态。研究者对多个数据库进行整合分析以确定所激活的旁路和潜在的治疗策略。研究者在体外研究、异种移植物和来自 160 例患者的样本中验证了电脑模拟的结果。

在上皮肿瘤患者中，有 16.1% 的患者出现 TRIM44 过度表达，在食管癌患者中有 8.1% 的患者出现过度表达，而在乳腺癌患者中有 6.1% 的患者出现过度表达。研究者采用荧光原位杂交法验证了该上述结果。siRNA 筛查则证实了 TRIM44 是扩增子的驱动者。

在患者样本中 TRIM44 和 p-mTOR 的比较

电脑模拟分析提示 TRIM44 和 mTOR 信号传导之间存在联系，表现为在 TRIM44 细胞系和 TRIM44 和 p-mTOR 共区域化的患者样本中，在敲除了 siRNA 中的 TRIM44 后，出现了 mTOR 信号传导的降低。

在离体试验中，在应用了 mTOR 抑制剂依维莫斯后，两个 TRIM44 扩增的细胞系的细胞生存能力分别降低了 88% 和 70%，而在对照细胞系中仅降低了 35%。这些结果也出现在异种移植物模型中。

本研究结果指出，在食管癌和乳腺癌患者中，基因扩增驱动 TRIM44 过度表达。对于存在 TRIM44 扩增的肿瘤患者而言，靶向针对 mTOR 旁路进行治疗是治疗选择之一。