我的博文

便宜的耐药机制怎么做?

2015-02-15 01:10  阅读(325)  评论(0)  分类:论文写作

可能大家都遇到过这样的窘境,经费不足,但是又要做深入机制。那怎么办呢?不能做PulldownY2HCoIP,芯片等等等等大实验,那怎么做机制啊!?遇到这样的情况,大家基本上都会束手无策。

有什么办法么?办法倒也不是没有。经费少,机制也有便宜的做法……

用小林子要研究的这个耐药相关基因作为例子,给大家介绍一下李莫愁师姐教小林子的应对办法吧。


第一点:做好功课

  小林子手里的这个基因的表型是与肠癌耐药相关的,具体机制没有报道过。但这是一类家族蛋白,同源的一些蛋白是有过报道的。Bingo,搜一下这些同源蛋白研究过的文献这是第一步。很多情况下,这样的文献搜索可以帮你缩短寻找通路的时间,同时也是对下一步研究的一个提示。

第二点:共表达试验

  如果研究的未知基因是一个转录因子,或者未知基因下游通路中有转录因子活性,那研究它与下游基因的共表达是显而易见的工作。筛选一些可能与耐药相关的基因,研究敲减未知基因后的下游基因变化,就可以做一点浅表的耐药机制研究了。

第三点:激酶的话怎么做?

  如果未知基因可能是一个激酶,就需要做一些磷酸化的Western Blot,那也是选择明星的通路,例如AKTERK等等。一旦建立了联系,就像是钓到宝了一样。你要问有这么大的可能性,一筛就中的么?我要告诉你的是,这是在做好第一点的前提下。

第四点:抑制剂实验 

  如果未知基因已经联系上了明星通路,也联系上了耐药的明星分子,那怎么继续呢?那就用通路抑制剂抑制后,看耐药变化,将三者串连在一起。那样一篇简单机制的文章就这么诞生了。

 

  这样算下来,也就是做点基因敲减,qPCR和Western,最多加一点抑制剂。除去人工(小林子这样的免费劳动力),成本最高的也就是抗体,总体来说不算是很高,也能解决目前基本的问题了。


 

我要评论

0条评论