个人资料

博文分类

我的博文

Vandy访学记------浅谈科研标本的珍贵性

2022-05-30 23:50 阅读(45) 评论(0) 分类:文娱

      在美帝做科研收集标本可不是一件容易的事情,没有足够的财力是做不起来的。我所在的Vandy流行病学中心有自己的实验室,这个实验室做一些细胞、病理及分子生物学等实验,还有一个功能就是处理收集来的标本。当然标本很多类型,包括血液、分泌物及组织等。我只是把我所见的关于病理标本的处理方式和大家分享。

这里收集的标本大部分是多中心的收集,一个中心的样本肯定是不够去做研究的,所以第一步多中心合作要建立起来,这一步没有相当的外交功底和实力也很难去做。建立了合作协议之后,知情同意肯定是必须的,甚至每个患者都需手签协议,已备伦理审查,然后就是费用了,患者的费用、取样医生的费用等等,这样一个病理标本下来基本需要3-400美金,美帝是没有免费的午餐的,想想流行病学往往是大样本的研究,光收集标本的费用就不简单的,没有大的grant资助肯定是行不通的。标本收集好了之后就邮寄过来,如果是新鲜的固定标本,这边实验室包埋成蜡块保存,供后续实验使用。新鲜固定的标本往往是临床前瞻性的研究所需要的,还有一部分标本是送来的蜡块或切片,这些往往是肿瘤病例,这些标本来了之后就进行标本处理,成为流行病学中心的样本库,积累多年以后,样本量越来越大,资源也相对丰富,这样一来,后续如果要做哪一个方面的研究,就方便了,当然也方便对外合作。这也是一种资源型科研方法。简单来说,我不一定有一个非常专的专长,或者我不一定持续只做某一个感兴趣的方向,但是我有足够的资源,哪个地方是研究热点,我就往哪个地方去做,这样的好处就是申请grant相对容易,因为grant往往资助一些比较新的热点问题,比如Covid-19。只有有了grant才可能生存下来,才可能满足自己的科研爱好,否则都是空谈。

接着再说病理标本的处理,随切片或蜡块而来的还有当地医院的诊断报告,首先要复阅一下切片,看一下诊断是否一致,大部分可能没有什么问题,也有少数情况,诊断也不怎么靠谱或规范,然后把标本的所有信息输入电脑系统,苏老师自己用Access建立了一个标本数据库,和实验室其他老师共享,这样每个标本的详细信息都会记录在这个数据库里面,随时可以调阅,技术员也会把标本对应的切片信息输入数据库,使得数据比较完整。当然Vandy自己开发的REDcap软件也很厉害,也有很多实验人员使用REDcap软件来进行数据存储。

由于其他中心寄过来的蜡块或切片,有的蜡块是需要寄回去的,因此这边将这些需寄回去的蜡块会切多张白片保存,有些蜡块制作成组织芯片,方便后期研究,这些切的白片都会按照病例的顺序一一编号,并进行封蜡处理,处理后的切片也按照编号顺序放入玻片盒里,再放入0度的一个冷冻库房里真空保存,这样切片的保存时间会很长,组织的蛋白不易丢失,以后不论做什么科研,能保证切片的质量。由于标本的收集是非常的不容易,因此也显得弥足珍贵,所以这边对每次切片时修剪蜡块的组织碎屑也要保存下来,放入小管中,编号处理,这些组碎屑可用来提一些DNA之类实验。每切下一个蜡块之前都需要对切片机进行清洁,防止污染。这项工作看起来简单,实质非常的繁琐和细致,需要技术员有足够的耐心和定力。

      以上只是我所见的Vandy流行病学中心实验室的一些病理标本的处理方法,当然,不一定是最好的,但是这种珍惜标本的态度,是值得我们去学习的,还有标本的数据化处理也是将来我们自己生物样本库需要做的事情。


 

我要评论

loading...

0条评论